Alamethicin - Alamethicin

Alamethicin
Alamethicin.png
Namen
IUPAC-Name
N- Acetyl-2- methylalanyl- L- Prolyl-2-Methylalanyl- L- Alanyl-2-Methylalanyl- L- Alanyl- L - Glutaminyl -2-Methylalanyl- L- Valyl-2-Methylalanylglycyl- L- Leucyl-2- Methylalanyl- L -prolyl- L -valyl-2-methylalanyl-2-methylalanyl- L -α-glutamyl- N 1 -[(1 S )-1-Benzyl-2-hydroxyethyl]- L -glutamamid
Bezeichner
3D-Modell ( JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
ECHA-Infokarte 100.121.626 Bearbeite dies bei Wikidata
UNII
  • InChI=1S/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1 prüfenJa
    Schlüssel: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N prüfenJa
  • InChI=1/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1
    Schlüssel: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
  • CC(C)C[C@@H](C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C( C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C( =O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)CO)NC(=O)CNC(=O )C(C)(C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](CCC( =O)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C( C)(C)NC(=O)[C@@H]3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
  • CC(C)CC(C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(C)(C)C( =O)NC(C)(C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)NC(CCC(=O)N)C(=O)NC(Cc2ccccc2)CO)NC (=O)CNC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(CCC( =O)N)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(= O)C3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
Eigenschaften
C 92 H 150 N 22 O 25
Molmasse 1964,31 g/mol
Aussehen Weißer Feststoff
Schmelzpunkt 255 bis 270 °C (491 bis 518 °F; 528 bis 543 K)
Unlöslich
Löslichkeit in DMSO , Methanol , Ethanol Löslich
Sofern nicht anders angegeben, beziehen sich die Daten auf Materialien im Standardzustand (bei 25 °C [77 °F], 100 kPa).
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Infobox-Referenzen

Alamethicin ist ein kanalbildendes Peptid antibiotische , produziert von dem Pilz Trichoderma viride . Es gehört zu den Peptaibol- Peptiden, die den nicht-proteinogenen Aminosäurerest Aib ( 2-Aminoisobuttersäure ) enthalten. Dieser Rest induziert stark die Bildung einer alpha-helikalen Struktur. Die Peptidsequenz ist:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = Acetyl, Phl = Phenylalaninol , Aib = 2-Aminoisobuttersäure )

In Zellmembranen , bildet es Spannung -abhängigen Ionenkanäle durch Aggregation von vier bis sechs Molekülen .

Biosynthese

Es wird angenommen, dass die Alamethicin-Biosynthese durch die Alamethicin-Synthase katalysiert wird, eine 1975 erstmals isolierte nichtribosomale Peptid- Synthase (NRPS). Obwohl mehrere Sequenzen des Alamethicin-Peptids akzeptiert werden, deuten Hinweise darauf hin, dass diese alle dem allgemeinen NRPS-Mechanismus mit kleinen Variationen an ausgewählten Aminosäuren folgen . Beginnend mit der Acylierung des N-Terminus der ersten Aminoisobuttersäure am ALM-Synthase-Enzym durch Acetyl-CoA folgt die sequentielle Kondensation von Aminosäuren durch jede modulare Einheit der Synthetase. Aminosäuren werden zunächst durch einen „adenyliert Adenylylierung “ (A) Bereich durch eine vor angebracht ist Thioester - Bindung an einem Acylträgerprotein -ähnlichen Peptidyl Trägerprotein. Die wachsende Kette wird durch die "Kondensation" (C)-Domäne an das Aminosäure-tragende PCP angehängt, gefolgt von einer weiteren Runde der gleichen Reaktionen durch das nächste Modul.

Alt-Text
Der allgemeine Mechanismus der NRPS-Synthese in Alamethicin, der die Kondensation von Aminosäuresubstraten von Modul zu Modul zeigt. Ac = Acetyl Aib = Aminoisobuttersäure. Modulkomponenten: A= Adenylylierung PCP= Peptidyl Carrier Protein C=Kondensation

Der Zusammenbau wird durch Zugabe von Phenylalaninol, einem ungewöhnlichen Aminosäure-ähnlichen Substrat, abgeschlossen. Nach Zugabe von Phenylalaninol wird die fertige Peptidkette durch die Thioesterasedomäne gespalten, wobei die Thioesterbindung gespalten wird und ein Alkohol zurückbleibt.

Alt-Text
Ein Diagramm der einzelnen Module und Verlängerung der Alamethicin-Biosynthese. Für jedes Modul ist die wachsende Peptidkette dargestellt, die mit der Spaltung des Thioesters und der Bildung von linearem Alamethicin endet. Ac = Acetyl Aib = Aminoisobuttersäure Pheol = Phenylalaninol. Modulkomponenten: A=Adenylierung PCP= Peptidyl Carrier Protein C=Kondensation

Verweise

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